Заболеваемость малярией выражается как количество новых случаев малярии на 100 000 человек каждый год. Число случаев корректируются для того, чтобы учесть недочет в системах отчетности, в количестве пациентов, обращающихся за лечением в частный сектор или занимающихся самолечением или не обращающихся к помощи врачей, и в потенциальной гипердиагностике через отсутствие лабораторного подтверждения случаев.
| 2000 | 2005 | 2010 | 2011 | 2012 | 2013 | 2014 | 2015 | 2016 | 2017 | 2018 | 2019 | 2020 | 2021 | 2022 | 2023 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Бенин | 412,5 | 502,4 | 414,4 | 381,4 | 364,5 | 362,0 | 369,5 | 392,8 | 419,9 | 418,7 | 409,3 | 401,1 | 378,3 | 379,0 | 377,9 | 363,4 |
| Буркина Фасо | 597,2 | 528,5 | 568,4 | 554,7 | 533,4 | 487,1 | 446,1 | 418,0 | 373,2 | 356,6 | 356,2 | 356,5 | 378,2 | 378,6 | 356,3 | 353,5 |
| Кот Д'Ивуар | 489,8 | 478,9 | 457,8 | 459,9 | 374,8 | 287,4 | 259,1 | 241,7 | 244,0 | 254,2 | 269,4 | 276,2 | 278,3 | 274,2 | 266,5 | 251,4 |
| Гвинея-Биссау | 409,3 | 93,8 | 126,5 | 130,6 | 126,9 | 121,9 | 106,8 | 90,5 | 75,0 | 65,1 | 66,5 | 74,8 | 94,4 | 106,2 | 110,9 | 104,0 |
| Мали | 395,0 | 419,8 | 373,6 | 394,2 | 424,3 | 441,0 | 429,5 | 381,7 | 374,4 | 377,0 | 377,2 | 325,8 | 349,4 | 345,9 | 346,2 | 346,2 |
| Нигер | 359,2 | 310,5 | 410,1 | 424,0 | 428,0 | 416,7 | 410,1 | 404,9 | 389,3 | 367,8 | 349,8 | 332,6 | 330,8 | 304,2 | 305,1 | 305,1 |
| Сенегал | 233,1 | 132,6 | 60,4 | 48,3 | 53,0 | 59,0 | 39,0 | 67,3 | 45,5 | 52,1 | 65,8 | 41,1 | 43,0 | 54,7 | 57,5 | 66,4 |
| Того | 436,1 | 466,9 | 311,4 | 304,8 | 333,8 | 368,0 | 367,2 | 354,0 | 319,4 | 275,5 | 250,2 | 236,8 | 241,5 | 239,0 | 237,6 | 230,3 |