Заболеваемость малярией выражается как количество новых случаев малярии на 100 000 человек каждый год. Число случаев корректируются для того, чтобы учесть недочет в системах отчетности, в количестве пациентов, обращающихся за лечением в частный сектор или занимающихся самолечением или не обращающихся к помощи врачей, и в потенциальной гипердиагностике через отсутствие лабораторного подтверждения случаев.
| 2000 | 2005 | 2010 | 2011 | 2012 | 2013 | 2014 | 2015 | 2016 | 2017 | 2018 | 2019 | 2020 | 2021 | 2022 | 2023 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ботсвана | 17,2 | 1,2 | 1,7 | 0,5 | 0,2 | 0,5 | 1,4 | 0,3 | 0,7 | 2,0 | 0,5 | 0,2 | 1,1 | 0,7 | 0,3 | 0,5 |
| Намибия | 53,6 | 41,8 | 1,6 | 1,8 | 3,1 | 4,4 | 14,1 | 8,0 | 16,6 | 44,8 | 24,6 | 2,7 | 9,3 | 9,6 | 7,3 | 8,2 |
| Южная Африка | 3,9 | 1,6 | 1,5 | 1,9 | 1,2 | 1,6 | 2,1 | 0,9 | 0,8 | 4,1 | 1,6 | 0,8 | 0,7 | 0,5 | 0,3 | 0,8 |
| Eswatini | 2,7 | 0,9 | 0,9 | 1,2 | 1,3 | 2,3 | 1,2 | 1,0 | 0,8 | 1,4 | 2,1 | 0,8 | 0,7 | 1,5 | 0,6 | 1,7 |